近年来，全国工商系统深化食品安全治理整顿。据统计，截至2013年3月底，全系统共查处流通环节食品安全案件52万件，案值21.88亿元，移送司法机关509件。
在食品流通环节，各级工商机关加大市场巡查和抽检工作力度，严把食品经营主体准入关，严格监管食品质量，切实规范经营行为，日常监管的针对性和有效性不断提升。截至2013年3月底，全国食品经营主体共计645万户。其中2012年新核发食品流通许可证146.46万个；抽检食品41.44万组，综合合格率93.06%，流通环节食品安全日常监管规范化建设取得新进展。
同时，各级工商机关积极督促食品经营者建立健全各项自律制度，监督食品经营者把好食品的进货关、销售关和退市关，督促经营者切实对消费者负责，为促进源头治理、建设社会诚信体系发挥了积极作用。
为提升依法行政能力和监管效能，各级工商机关不断提升信息化监管水平。北京以食品安全监控中心为核心建设了4个层级的食品安全风险评估技术支撑体系；湖北以监管责任落实率、电子监管应用率、问题食品处置率、案件数量占比率等“十率”为主要考核指标，推动属地监管责任制落实。
